Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ECM1Q16610 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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