Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SYPL1Q16563 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYPL1Q16563 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYPL1Q16563 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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