Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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