Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA1Q15788 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms