Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIXQ14938 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms