Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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