Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1A4Q13733 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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