Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1SQ13698 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms