Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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