Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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TCIRG1Q13488 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TCIRG1Q13488 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TCIRG1Q13488 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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