Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms