Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MKRN3Q13064 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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