Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN2AQ12879 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
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