Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms