Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms