Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms