Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms