Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSBP1Q04837 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSBP1Q04837 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms