Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RELAQ04206 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms