Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms