Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms