Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms