Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms