Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EFNB1P98172 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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