Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIM1P81133 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIM1P81133 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SIM1P81133 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms