Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms