Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM3BP58499 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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