Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEMP55040 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEMP55040 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms