Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms