Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms