Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCT3P49368 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCT3P49368 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms