Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCLMP48507 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCLMP48507 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms