Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA8P48165 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA8P48165 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms