Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms