Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPS1P31327 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPS1P31327 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms