Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms