Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ARID4AP29374 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ARID4AP29374 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms