Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP11P24347 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms