Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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