Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJB1P08034 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms