Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN1SWP03999 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms