Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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