Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF208O43345 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF208O43345 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF208O43345 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF208O43345 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF208O43345 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF208O43345 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF208O43345 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF208O43345 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF208O43345 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF208O43345 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF208O43345 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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