Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA1C9JL84 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA1C9JL84 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms