Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP3BA6NNM3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms