Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP5A6NIR3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms