Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL33A6NCF5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms