Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms