Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX13Q9Y5W8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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