Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNPO3Q9Y5L0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms